研究建立基于CRISPR-Cas13关键技术的环形RNA功能筛选新方法
2023-04-07 职场
Nature Protocols 离线登载了中会国科学院化学键巨噬细胞科学卓著创造性中会心姚大姐分别独立撰稿的科学研究博士论文( Screening circular RNAs with functional potential using the RfxCas13d/BSJ-gRNA system )。该科学研究解读了分别独立建立的基于CRISPR-Cas13电子技术的外末端RNA选取近期。
外末端RNA是一类共价闭末端的单链RNA,巨噬细胞内大多数外末端RNA是由mRNA前体的外显子通过偏置剪接呈现出。除偏置剪接启动子(BSJ)外,外末端RNA在核苷酸上与其相合的线形RNA在一级核苷酸上大致相同,因此,在科学研究外末端RNA新功能时如何将其与相合线性RNA的新功能分辨开来是该课题的难题之一。姚大姐分别独立前期开发并构建了基于CRISPR-Cas13的RNA总编辑电子技术,能够抗体敲除靶标外末端RNA,而不影响其相合线性RNA的传达,并应用于在外末端RNA的大规模新功能选取上(Li et al., Nature Methods , 2021)。基于CRISPR-Cas13在外末端RNA新功能科学研究上的电子技术成果,分别独立受 Nature Protocols 邀请,论述该电子技术的实验者方法和系统设计以期推动该电子技术在外末端RNA新功能科学研究课题的应用于。
在该实验者方法中会,科研人员解读了外末端RNA BSJ启动子的前导RNA(gRNA))文库设计和框架、RfxCas13d稳定传达巨噬细胞系框架、巨噬细胞技术水平和体内技术水平的新表征外末端RNA选取以及选取结果的计算分析系统设计等。此外,科学研究也说明了实验者过程中会显然遇到的问题与简介。该方法为外末端RNA的新功能科学研究提供助力,并为揭示外末端RNA奠定新的电子技术基础。
科学研究计划获得国科会、中会科院和国家科技进步奖的支持者。
基于CRISPR-Cas13电子技术的外末端RNA新功能选取系统设计
是从:中会国科学院化学键巨噬细胞科学卓著创造性中会心
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